芯原力开发了一系列自主知识产权的分析软件,尤其在检测免疫治疗关键信息—neoantigen的核心算法方面具有独特优势,并建立中国人群肿瘤neoantigen数据库,目前已构建3个核心数据库:HLA单分型提呈抗原数据库、 肿瘤新生抗原数据库、抗原免疫原性及T细胞受体(TCR)免疫组库数据库。并且基于该数据库开发了一套人工智能软件,实现精准免疫治疗所需要的肿瘤新生抗原的鉴定及优选,可以实现对每一位肿瘤患者,快速准确地预测其肿瘤新生抗原以及能够被免疫细胞识别的新生抗原。这将为个体定制化的精准免疫治疗提供最准确的设计靶点,为治疗的有效性及安全性提供保障。
应用方向
产品介绍
iNeo-Panorama系列产品运用高通量测序技术(NGS)、免疫组化等多种临床“金标准”技术,实现了从DNA、 RNA和蛋白质多个维度的对患者肿瘤细胞中所有蛋白编码基因的检测,是目前比较全面的基因检测方案。
深度全外显子测序,包含所有外显子区域和部分内含子区,以及转录组测序,能够满足临床不同分析要求。
能够匹配全球已上市的抗癌药品,以及Ⅲ期临床研究正在开发的药物。
利用浙江大学、加拿大UBC和iNEO独立自主专利的算法评估,并行评估患者个体化免疫治疗可行性。
深度全外显子测序,包含所有外显子区域和部分内含子区,以及转录组测序,能够满足临床不同分析要求。
芯原力建立了人工智能自动化鉴定及优选系统,建立了针对T细胞表位中MHC分子与抗原结合亲和力的预测模型,针对中国人群的实验数据训练集,整合多种机器学习及人工智能模型,并且该模型已经在临床实验中得到>80%的免疫响应验证,全面提高了T细胞表位预测准确性,Benchmark标准数据横向评测结果最优,特别是对中国人群高频HLA有明显提升,是目前公开软件中性能最佳的。另外,通过考虑有关表位递呈能力以及表位识别能力等相关因素,包括序列同源性、毒性、活性等安全风险排除,完成多表位整合的疫苗序列设计。
平台特点及优势
1、采用人工智能高性能算法和模型,自动化设计新生抗原肿瘤疫苗
2、综合性多因素智能化人工智能新抗原优选程序
3、新抗原序列安全性评估策略
案例展示
本项临床研究在浙江大学附属邵逸夫医院完成,截止2019年5月入组治疗了22例标准治疗失败的泛癌种晚期实体瘤患者,90.9%的受试者均无严重不良反应;38.1%的受试者病灶在新生抗原多肽疫苗治疗过程中出现缩小,最大缩少比例为16.7%;证明了个体化疫苗的安全有效。
芯原力拥有国际领先的免疫细胞体外刺激与扩增技术,与新生抗原疫苗设计平台巧妙的结合,助力基于新生抗原的细胞治疗产品的研发,已完成开发的产品有基于新生抗原的DC-CTL细胞治疗、DC-TILs细胞治疗、TCR-T细胞治疗等。
产品管线
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基于新生抗原的细胞治疗
1.采用患者的肿瘤样本和血液,利用芯原力高通量测序及生物信息分析平台进行测序找到患者的新生抗原信息;
2.利用基于人工智能的iNeo新抗原优选及疫苗设计平台,设计新生抗原多肽序列;
3.新生抗原多肽制备;
4.通过体外刺激的方式激活患者自身T细胞,然后体外训练出一只具有肿瘤杀伤功能的细胞军队;
5.临床回输细胞制品。
芯原力围绕新生抗原肽服务建立新生抗原肽合成、工艺开发、新生抗原肽池服务、新生抗原肽文库合成服务等,并开发了专业多肽评估工具,高效快速的完成新生抗原多肽疫苗的定制化生产。芯原力围绕个体化肿瘤疫苗与T细胞治疗产品,建立了一套快速高效的质量研究与控制体系,保质保量的完成客户要求的定制化肿瘤疫苗生产。
多肽疫苗版块
已建立一套适用于个体化肿瘤疫苗的生产工艺和质检体系,严格把控产品的纯度、含量、杂质、微生物等多项质检项,实现高效、快速、安全。
细胞产品版块
已建立一套个体化细胞治疗产品制备的生产工艺和质检体系,在确保采集与分离体细胞的收率、存活率、纯度、均一性等的前提下,同时严格控制体外扩增前、扩增时、扩增后的质量,实现稳定、可靠、合规。
平台拥有10种以上特定HLA分型的稳转或瞬转肿瘤细胞系,多种适用于个体化免疫治疗药效研究的免疫重建人源化PDX小鼠模型,以及一整套稳定的、特制的、完整且高效的药效评价系统,可以依照正交试验设计,三因素三水平,筛选出合适的佐剂、给药剂量和给药频率,通过对新型疫苗(治疗/预防)的体内药效和毒性评估,为优化疫苗设计、临床用药方案和临床用药安全提供重要的依据,并能通过一系列的指标设计阐明并验证药效作用机制。
利用肿瘤模型评估iNeo-P01的体内治疗效果及预防效果
利用细胞平台证明DC-CTL(iNeo-T01)在体外已经被激活并在体内具有杀伤肿瘤的特性
芯原力已开发多项适用于个体化免疫治疗疗效评估的临床监测技术,包括ELISpot检测、T细胞受体(TCR)测序、基于流式的T细胞功能检测、全景免疫荧光检测、个体化ctDNA检测、DNA/RNA双重基因检测等。
TCR检测
肿瘤患者治疗前后,通过观察T细胞受体多样性和克隆性改变,监测肿瘤疫苗是否激活了肿瘤患者体内的特异性T细胞。
Elispot特异性免疫检测
患者治疗前后的外周血的ELISpot实验,监测是否有新生抗原疫苗激发了抗原特异性的免疫响应。
全景免疫荧光检测
患者通过新生抗原肿瘤疫苗治疗前后的全景免疫组化,通过检测肿瘤浸润淋巴细胞数量及比例,监测肿瘤细胞微环境,以及是否有激活的CD8+T细胞和CD4+T细胞。
芯原力已建立了经验丰富的医学团队、数据管理团队,临床运营团队,并建立了电子化临床试验管理细胞,优化临床试验流程,提高工作效率,并可以提供方案撰写、伦理申请、临床试验数据管理、在线统计分析、报表智能导出等服务。
临床数据管理系统
智能化流程管理,优化数据交接过程; 临床试验数据采集、管理及在线分析; 保证实验室数据真实、可回溯; 工作任务提醒、智能工具 、在线编码 数据统计分析,报表智能导出;